بالإضافة إلى كونه ضروريًا لتخليق العديد من البروتينات المهمة للنبات، فإن التربتوفان هو مقدمة لعدد كبير من المستقلبات الثانوية، خاصة: الهرمونات النباتية المرتبطة بنمو الجذر، مثل الأكسينات، وأشباه القلويات المستخدمة من قبل النظام الدفاعي للنباتات ضد الحشرات والبكتيريات (التربتامين، الأمينات المشتقة من حمض الأنثرانيليك، الستريكتوسيدين، كامبتوثيسين، إلخ).