Los ácidos húmicos lo forman principalmente grupos funcionales de carácter ácido como grupos fenólicos o carboxílicos. De hecho, pueden ser extraídos por reactivos como bases fuertes, sales neutras, quelatos o solventes orgánicos y son insolubles en ácidos diluidos.

Son productos de polimerización o condensación de los propios ácidos fúlvicos y de otros productos en descomposición. Sus moléculas tienen un peso comprendido entre 20.000 y 1.360.000 D.

Los ácidos fúlvicos en cambio contienen grupos funcionales de carácter básico que de hecho precipitan con ácido diluido. Son considerados productos de descomposición de residuos de planta superiores y residuos microbianos, con pesos moleculares comprendidos entre 275 a 2110 D.