مثل الأحماض الأمينية الأخرى، فهو جزء من البروتينات المهمة للخلايا. هو جزيء الكبريت العضوي الرئيسي. من سلائف تخليق الميثيونين، الجلوتاثيون (مضادات الأكسدة الرئيسية للنباتات)، الفيتامينات، العوامل المساعدة والمركبات التي تشكل جزءًا من النظام الدفاعي للنباتات (الجلوكوسينولات، الثيونين والفيتوإليكسين. السيستئين هو مستقلب حاسم في نظام الدفاع عن النباتات.
بالإضافة إلى ذلك، فإن بعض الدراسات تربط تحمل حالات الإجهاد الناجمة عن المعادن الثقيلة (الزنك Zn و الكادميوم Cd) مع تراكم السيستئين في النباتات.