النباتات تمتص المغنيزيوم في شكله الكاتيونيMg+. وظيفته الرئيسية تتمثل في أنه المُكَوِّن لجزيء الكلوروفيل. يتم دراسته مع الكالسيوم والبوتاسيوم (على الرغم من أنه أقل وفرة) ويشكل ما بين 0,3-0,5% من الوزن الجاف.
المغنيزيوم الذي هو جزء من الكلوروفيل هو فقط يمثل 10-15 ٪ من المجموع الكلي. يعمل الباقي كمنشط أنزيمي وعامل مساعد لجميع الأنزيمات المشاركة في التمثيل الغذائي الطاقي للنبتة. وكذلك في عملية التمثيل الغذائي للسكريات، في تركيب الأحماض النووية والبروتينات والنسخ. لذلك يمكن القول أن المغنيزيوم يلعب دورًا مزدوجًا في النباتات: من الناحية التركيبية (يشكل جزءًا من جزيء الكلوروفيل) ومن ناحية وظيفية أخرى (كمنشط أنزيمي).
في تحركات النسيج اللحائي يرتبط بالبوتاسيوم، لذلك فإن دوره في تطوير الثمار مهم.
نقص المغنيزيوم: هو عنصر متنقل للغاية ونقصه يتمثل في شحوب الأوراق القديمة. ذلك لأن الخلايا الأقرب إلى الأعصاب تحتفظ بالكلوروفيل بدرجة أكبر من بقية الخلايا.
فيما يتعلق بنقص المغنيزيوم يلاحظ ما يلي:
احتياج أكبر إلى هذا العنصر في ظروف الضوء العالي.
تفاقم المشكلة الطارئة في التربة الحمضية المرشحة مع سمية Al في حالة نقص المغنيزيوم. يمتلك المغنيزيوم (والكالسيوم) القدرة على إطلاق جزيئات عضوية تشكل روابط ثابتة مع الألومنيوم.
صعوبة أكبر في نقل السكريات عن طريق النسيج اللحائي. تقييد نقل السكروز الى النبات.
انتشار أقل للجذور بالمقارنة مع الظروف التي تكون فيها مستويات المغنيزيوم عادية.
لذلك، يجب الحفاظ على ظروف جيدة للمغنيزيوم في النبات لتجنب حدوث نقل الاستيعاب الضوئي الغير المناسب إلى مصارف النبتة.
فيما يتعلق بالنقص المحتمل للمغنيزيوم، تلاحظ التكوينات السيئة للجذور في التبغ، في الفاصوليا، شحوب الأوراق في القهوة، وفي الطماطم، وخاصة البقع المزرقة داخل العروق مع اصفرارات متدرجة.
المغنيزيوم الزائد: كما في حالة البوتاسيوم والكالسيوم، المغنيزيوم الزائد يمكن أن يؤدي إلى نقص غير مباشر للبوتاسيوم والكالسيوم بسبب التداخل بينها.