Comme d’autres acides aminés, il fait partie des protéines importantes pour les cellules. Étant un acide aminé chimique et biologiquement assez inerte, l’asparagine est utilisée comme molécule de stockage et de transport de l’azote dans de nombreuses plantes. Il s’agit en fait du plus grand transporteur d’azote à la fois dans le xylème et dans le phloème. Dans la fixation de l’azote dans les légumineuses, l’asparagine est le produit final le plus élevé et s’accumule à des concentrations élevées dans les nodules et les exsudats du xylème des racines. L’asparagine s’accumule intensément dans les graines en germination, considérant cet acide aminé comme le plus important, quantitativement, dans les processus de germination des graines. De nombreuses études montrent également l’accumulation de cet acide aminé dans des situations de stress dû à la sécheresse, à une carence en phosphore, à un empoisonnement par le soufre ou aux métaux lourds.