Como otros aminoácidos forma parte de proteínas importantes para las células. Al ser una aminoácido química y biológicamente bastante inerte, la asparagina es usada como molécula de almacenamiento y transporte de nitrógeno en por muchas plantas. Es, de hecho, el mayor transportador de nitrógeno tanto en el xilema como en el floema. En la fijación de nitrógeno en leguminosas, la asparagina es mayor producto final y se acumula en altos niveles en los nódulos y exudados del xilema de las raíces. La asparagina se acumula intensamente en las semillas en germinación, considerándose a este aminoácido como el más importante, cuantitativamente, en los procesos de germinación de las semillas. Numerosos trabajos demuestran también la acumulación de este aminoácido en situaciones de estrés producidas por sequía, deficiencia de fósforo, de azufre o intoxicación por metales pesados.