Embora as plantas estejam imóveis, elas têm uma série de características que lhes permitem interagir com o meio ambiente, como a autotrofia (elas são capazes de fabricar seus próprios alimentos através da fotossíntese), a presença de uma parede celular, e a lignina, que as confere rigidez para poder expandir-se na terceira dimensão e desta maneira alcançar as fontes de nutrientes (luz, CO2, água e sais minerais).

Como em qualquer interação, é necessário transmitir informações de uma parte do organismo para outra, e até mesmo entre indivíduos diferentes. A transmissão de informações nas plantas é realizada por substâncias químicas chamadas hormonas vegetais.

Como mencionado, existem microrganismos capazes de sintetizar as auxinas. Em muitos casos, são microrganismos fortemente ligados ao reino vegetal, como as bactérias da rizosfera (Pseudomonas, Azospirillum …) e são o produto da co-evolução das plantas com os microrganismos.

Para exercitar sua ação, as auxinas são reconhecidas na planta por uma série de receptores. Para serem reconhecidos, eles devem atender a uma série de requisitos na sua estrutura. A molécula AIA foi estudada como um modelo e foi estipulado que a distribuição e a distância entre a carga positiva e negativa são importantes na determinação da função auxínica, onde a presença do anel indol não é uma condição essencial como se pensava inicialmente. Desta forma, existem moléculas com função auxínica sem o anel indol.

As auxinas intervêm no crescimento celular, controlando a divisão celular e, assim, influenciando a formação das raízes secundárias. Por esta razão, elas são amplamente utilizadas na agricultura para o enraizamento das mudas. Eles também intervêm na dominância apical, no crescimento do caule, na diferenciação vascular (principalmente no cambium), no ordenamento das folhas no caule (processo denominado filotaxia), ou nos processos de abscisão de folhas e frutos.