Como outros aminoácidos, faz parte das proteínas importantes para as células. Além da tirosina (como a fenilalanina), destaca por estar envolvida na síntese de numerosos metabolitos secundários, uma vez que do seu catabolismo se originam: cumarinas, flavonóides, estilbenos, isoflavonóides, aurones, cutina, suberina, esporopolenina, catequina, proantocianidinas, lignana, ligninas, fenilpropeno e numerosos alcalóides; compostos que fornecem à planta resistência mecânica, proteção contra a radiação UV, resistência à doenças, seca e de pragas, viabilidade dos grãos de pólen, etc.