Como outros aminoácidos, faz parte das proteínas importantes para as células. Embora a alanina não seja considerada um aminoácido especialmente importante na captação do azoto ou na sinalização celular, ela tem uma importância especial para o metabolismo das plantas e para superar as situações de stress. A alanina é o principal transportador do azoto biológico das bactérias fixadoras de azoto para a planta. Muitos estudos têm sido descritos nos quais a importância desse aminoácido é demonstrada nas situações de stress como hipóxia, stress salino, seca, stress biótico, etc. A prova disso é que, quando as plantas são submetidas às condições de stress, elas respondem acumulando grandes quantidades de alanina. Como a valina, leucina ou isoleucina, a alanina é um precursor de álcoois e outros compostos que melhoram as qualidades organolépticas dos frutos.

A alanina serve como um precursor de alguns metabólitos secundários, como os glucosinolatos.