Como outros aminoácidos, forma parte das proteínas importantes para as células. A arginina é usada como uma molécula de armazenamento e transporte de azoto em muitas plantas. A arginina induz a síntese das hormonas de frutas e flores. É um precursor da síntese de poliaminas (putrescina, espermidina e espermina), prolina, alcalóides, ornitina, citrulina e óxido nítrico. Também é importante para superar as condições de stress. Estudos realizados sobre a aplicação da arginina na rizosfera mostraram um aumento no número das raízes. A arginina promove o efeito positivo da auxina, IBA, nas raízes, aumentando tanto o número de raízes quanto o comprimento.