مثل هذه الأحماض الأمينية الأخرى، فهو جزء من البروتينات المهمة للخلايا. بسبب الخاصيات الكيميائية لمجموعتها إيميدازول، الهستيدين هو جزء من المركز النشط للعديد من الأنزيمات ذات نشاط التحفيز الحمضي القاعدي. بالإضافة إلى ذلك، وبفضل مجموعته من الإيميدازول، ينسق بسهولة مع المعادن (النيكل، الزنك، النحاس) مما يزيد من قدرة النباتات على مقاومة حالات الإجهاد التي تسببها هذه المعادن. بفضل الهستيدين، تستطيع بعض النباتات تجميع كميات كبيرة من النيكل في الجذور، ويعتقد أن هذا التراكم المفرط للنيكل لديه نشاط دفاعي ضد بعض النباتات.