Como outros aminoácidos, forma parte das proteínas importantes para as células. Sendo um aminoácido químico e biologicamente bastante inerte, a asparagina é usada como uma molécula de armazenamento e transporte de azoto em muitas plantas. É, de fato, o maior transportador de azoto tanto no xilema quanto no floema. Na fixação do azoto nas leguminosas, a asparagina é o maior produto final e se acumula em altos níveis nos nódulos e exsudatos do xilema das raízes. A asparagina se acumula intensamente nas sementes germinativas, sendo este aminoácido considerando o mais importante, quantitativamente, nos processos de germinação das sementes. Numerosos estudos também mostram o acúmulo deste aminoácido nas situações de stress produzido pela seca, deficiência de fósforo, enxofre ou intoxicação por metais pesados.